Volt két nővére, akiket ő ölhetett meg

Bátyja-férjein kívül Kleopátrának volt két nővére, IV. Berenice és IV. Arszinoé. Berenice volt az öt testvér közül a legidősebb, és amikor apja elment Rómába, a Kr.e. 58-ban a távollétében királynővé tette magát.
Berenice elvetette magát Seleucus nevű unokatestvérével, hogy megszilárdítsa trónra való igényét, ám az esküvő után egy héten belül meggyilkolták a férjét, a nőt pedig kivégezték.
Kleopátra kishúga, Arszinoé ugyanolyan ambiciózus volt, mint családja többi része. Ő Kr.e. 48-ban kiáltotta ki magát királynőnek és Kleo ellen fordult, de akkor Cézár tett pontot az ügy végére. Caesar megkímélte Arszinoé életét és az epheszoszi szentélyébe vitették VII. Kleopátra beleegyezett, hogy kölcsönt ad Antoniusnak, ha IV. Arszinoét kivégzik és meg is tették.