Azonban a kereszténység ennél szorosabban kapcsolódik az unikornis mítoszához: a középkori krónikások előszeretettel foglalkoztak a csodalény szimbolikájával. A hagyomány szerint csupán egyetlen módja ismeretes az egyszarvúak befogásának, amihez mindenképpen szükségünk lesz egy szűz leányzóra. Ha az állat ugyanis megérzi a lány finom illatát, az a fejét szelíden az ifjú ölébe hajtja. A patás fenséges mivolta és tisztasága miatt néhány szerző Jézus alakját véli felfedezni az egyszarvúakban, míg a szűz lányt Máriával helyettesítették. Az unikornis a középkori regék alapján új képességekre is szert tett – úgy tartották, hogy minden mérgezett víz azon nyomban megtisztul, ahogy a teremtmény belemártja abba hosszú szarvát.